34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0715 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0715  hydrogenase maturation protease superfamily  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0859564  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  82.19 
 
 
150 aa  256  9e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0123  hypothetical protein  73.97 
 
 
154 aa  227  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1870  hydrogenase maturation protease  63.7 
 
 
148 aa  210  7e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  29.58 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  29.58 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  28.87 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  28.17 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  28.87 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  28.87 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  35.09 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  29.58 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  29.58 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  29.58 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  29.58 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  29.58 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  29.58 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  29.58 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  29.58 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0451104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  29.58 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  27.78 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  29.77 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  31.36 
 
 
159 aa  60.5  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  30.43 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  30.7 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  25.35 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  29.85 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  31.78 
 
 
201 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  28.89 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  32.76 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  29.92 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  29.01 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  29.2 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  26.76 
 
 
189 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>