20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09778 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  513  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  52.87 
 
 		 259 aa  254  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  46.33 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  37.44 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  39.07 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  37.74 
 
 		 233 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.38 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  37.71 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  32.75 
 
 		 208 aa  91.3  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  32.61 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  25.62 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.38 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.38 
 
 		 249 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  32.79 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  31.36 
 
 		 325 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.62 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  30.3 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1023 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>