20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05465 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  793    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  56.2 
 
 
402 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  45.36 
 
 
391 aa  285  8e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  40.75 
 
 
392 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  40.31 
 
 
394 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  36.24 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1258  conserved hypothetical protein, secreted  37.16 
 
 
375 aa  242  9e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  38.13 
 
 
400 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  37.4 
 
 
385 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  39.07 
 
 
386 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  34.7 
 
 
376 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  33.6 
 
 
390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  29.73 
 
 
386 aa  156  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  25.41 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  26.2 
 
 
351 aa  59.7  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  22.62 
 
 
344 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  25.87 
 
 
355 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  20.32 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  22.17 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  23.3 
 
 
346 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>