More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1828 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1828  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
240 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300709  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4835  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  97.08 
 
 
240 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.137601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5101  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  91.67 
 
 
240 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381438  decreased coverage  0.00220155 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5750  amino acid ABC transporter permease  87.08 
 
 
240 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  87.08 
 
 
240 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6596  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  87.08 
 
 
240 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20911 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5622  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  86.25 
 
 
240 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129998  normal  0.660092 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5839  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  86.67 
 
 
240 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  68.97 
 
 
241 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5921  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.24 
 
 
241 aa  309  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610786  normal  0.165756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2651  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.68 
 
 
240 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0430594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1257  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.54 
 
 
240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3519  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.62 
 
 
240 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405389  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.73 
 
 
232 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.38 
 
 
238 aa  232  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3872  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.65 
 
 
238 aa  228  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7240  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  52.19 
 
 
256 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0593694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4486  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.64 
 
 
232 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358946  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2377  ABC His/Glu/Gln/Arg/opine transporter, inner membrane subunit  43.86 
 
 
243 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413222  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.52 
 
 
246 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4638  amino acid ABC transporter permease  42.54 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.54 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.69 
 
 
240 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  38.14 
 
 
246 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003971  arginine/ornithine ABC transporter permease protein AotQ  38.14 
 
 
246 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2252  amino acid ABC transporter permease  45.25 
 
 
232 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1410  histidine ABC transporter, permease protein  42.98 
 
 
229 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.62 
 
 
229 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.28 
 
 
230 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
229 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3607  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
229 aa  167  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488418  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
240 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.28 
 
 
267 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3796  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 
229 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.719623  normal  0.0561262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.7 
 
 
237 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1355  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  42.54 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1089  histidine ABC transporter, permease protein  42.54 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.518061  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1240  histidine ABC transporter, permease protein  42.54 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.842706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3875  amino acid ABC transporter permease  42.42 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0483  histidine ABC transporter, permease protein  42.54 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.158807  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0210  histidine ABC transporter, permease protein  42.54 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1959  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  38.14 
 
 
246 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.450154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5892  ABC transporter permease  41.78 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68080  ABC transporter permease  41.78 
 
 
231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  0.0204508 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1440  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  42.92 
 
 
371 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.524811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4137  amino acid ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1209  amino acid ABC transporter permease  41.92 
 
 
242 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1453  amino acid ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402633  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5003  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.42 
 
 
229 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3017  histidine ABC transporter, permease protein  39.29 
 
 
229 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.606762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1247  histidine transport system permease protein  39.29 
 
 
229 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0889  amino acid ABC transporter, permease protein  40.09 
 
 
229 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1094  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.29 
 
 
229 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1580  histidine ABC transporter, permease protein  39.29 
 
 
229 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
229 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0987  histidine ABC transporter, permease protein  39.29 
 
 
229 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1089  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.29 
 
 
229 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2782  amino acid ABC transporter permease  40.85 
 
 
238 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1791  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.06 
 
 
229 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369418  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5068  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.42 
 
 
240 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458442  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
229 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
253 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4287  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
229 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7394  ABC transporter membrane spanning protein  36.02 
 
 
240 aa  158  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  37.79 
 
 
229 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2732  amino acid ABC transporter, permease protein  40.27 
 
 
229 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2853  histidine transport system permease protein  40.27 
 
 
229 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2791  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  40.27 
 
 
229 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2857  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.36 
 
 
228 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.224945  normal  0.227891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2129  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.81 
 
 
260 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal  0.354244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  37.33 
 
 
229 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  41.06 
 
 
244 aa  156  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
229 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  41.06 
 
 
244 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0696  amino acid ABC transporter permease  39.91 
 
 
229 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1175  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
229 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  37.33 
 
 
229 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.25 
 
 
229 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2832  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  37.71 
 
 
246 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2789  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3448  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.01 
 
 
228 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2686  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.01 
 
 
228 aa  155  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.25 
 
 
229 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2927  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, innermembrane subunit  41.67 
 
 
233 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.25 
 
 
229 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.25 
 
 
229 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1377  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
229 aa  154  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1122  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.62 
 
 
229 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02233  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  38.57 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1348  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0592  arginine ABC transporter, permease protein  39.37 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0258675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02193  hypothetical protein  38.57 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1593  arginine transport system permease protein  39.37 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3391  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1429  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  37.61 
 
 
228 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0521843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2602  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  38.57 
 
 
228 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.311053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0352  histidine transport system permease HisQ  37.61 
 
 
228 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.05 
 
 
228 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>