91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3112 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3112  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985689  decreased coverage  0.0000131927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1417  membrane protein  89.91 
 
 		 126 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2016  hypothetical protein  64.22 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.220495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1937  membrane protein  66.95 
 
 		 121 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2215  membrane protein-like protein  64.58 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1080  hypothetical protein  70 
 
 		 137 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0531  hypothetical protein  71.43 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0787  hypothetical protein  71.43 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0629  hypothetical protein  71.43 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1793  hypothetical protein  71.43 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.28026  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5519  membrane protein-like  70 
 
 		 114 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.511237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2190  membrane protein-like protein  70 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5887  membrane protein-like  70 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2229  membrane protein-like protein  70 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2108  membrane protein-like protein  70 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1086  membrane protein-like protein  67.07 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1650  hypothetical protein  46.58 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00520982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0524  hypothetical protein  45.07 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2827  hypothetical protein  36.26 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0487  hypothetical protein  39.19 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0195334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1265  hypothetical protein  48 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00720  hypothetical protein  43.66 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2277  hypothetical protein  41.1 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1770  hypothetical protein  39.51 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0986234  normal  0.427935 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0318  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00269731  hitchhiker  0.00788498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1793  hypothetical protein  38.67 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000127525  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00159  hypothetical protein  31.87 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1262  hypothetical protein  42.47 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0702268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0087  hypothetical protein  43.84 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3461  membrane protein-like protein  36 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000680591  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  39.8 
 
 		 729 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2480  putative solute symporter protein  44.74 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.029038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002208  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2051  Maf-like protein  37.18 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2263  membrane protein-like protein  37.14 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3138  membrane protein-like protein  37.5 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1629  membrane protein-like protein  35.8 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.604047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1959  hypothetical protein  39.44 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.859068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0508  membrane protein-like protein  40 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1522  hypothetical protein  36.99 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2253  hypothetical protein  39.44 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.935196  normal  0.0501175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3833  membrane protein  38.46 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.536523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3040  hypothetical protein  37.93 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0631  hypothetical protein  39.74 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0463  hypothetical protein  39.73 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1864  putative solute symporter protein  42.67 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0698534  normal  0.307528 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4551  hypothetical protein  39.19 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0556  hypothetical protein  34.62 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3156  Maf-like protein  36.62 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3838  hypothetical protein  41.43 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3697  hypothetical protein  40.28 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1695  hypothetical protein  35.62 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.745801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1745  hypothetical protein  36.99 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.588903  hitchhiker  0.0000483214 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3755  hypothetical protein  40.28 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2372  hypothetical protein  35.62 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.810646  hitchhiker  0.000114993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1546  hypothetical protein  36.62 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.704875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4789  hypothetical protein  35.44 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2230  hypothetical protein  36 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273164  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4145  membrane protein-like  35.62 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257002  normal  0.0353718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1440  hypothetical protein  37.84 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2839  hypothetical protein  35.62 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.82179  hitchhiker  0.0000856342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0872  hypothetical protein  35.14 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.38299  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0577  hypothetical protein  36 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0901  hypothetical protein  36.49 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.703868  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0524  hypothetical protein  35.8 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1710  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000109022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2674  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2753  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2359  hypothetical protein  36.62 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3665  hypothetical protein  38.03 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2639  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1176  hypothetical protein  38.96 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1497  hypothetical protein  34.62 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.021579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4953  hypothetical protein  34.21 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2397  hypothetical protein  36.49 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0262  hypothetical protein  35.06 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2858  hypothetical protein  33.8 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  37.8 
 
 		 759 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0865  hypothetical protein  36.99 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0675484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3555  hypothetical protein  32.89 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  33.64 
 
 		 760 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4102  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1524  membrane protein  32.86 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.261907  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1574  hypothetical protein  33.8 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1580  hypothetical protein  33.8 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188511  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1513  hypothetical protein  33.8 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5742  putative solute symporter protein  31.62 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0280  membrane protein-like protein  32.39 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4039  putative solute symporter protein  34.67 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5063  hypothetical protein  37.88 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1041  membrane protein  39.13 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>