15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5052 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5052  conjugal transfer protein TraB  100 
 
 		 421 aa  844    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.195661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5093  conjugal transfer protein TraB  30.77 
 
 		 415 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.685787 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5512  conjugal transfer protein TraB  25.5 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569309  normal  0.0492499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1610  TraB family protein  24.87 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4542  conjugal transfer protein TraB  26.43 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325638  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9192  conjugal transfer protein TraB  22.03 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9597  conjugal transfer protein TraB  24.81 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7066  conjugal transfer protein TraB  22.45 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1421  conjugal transfer protein TraB  27.65 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5005  conjugal transfer protein TraB  23.67 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441858  normal  0.356102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1731  conjugal transfer protein TraB  27.06 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4489  conjugal transfer protein TraB  23.14 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0279  conjugal transfer protein TraB  25.13 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5391  conjugal transfer protein TraB  23.18 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970188  normal  0.166771 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5410  conjugal transfer protein TraB  23.96 
 
 		 417 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>