291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2376 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2376  thiosulphate-binding protein  100 
 
 
330 aa  670    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1543  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  92.26 
 
 
330 aa  596  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.513686  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1762  thiosulphate-binding protein  80.43 
 
 
332 aa  557  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.478994  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2961  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  79.34 
 
 
338 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0866  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  81.25 
 
 
334 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2545  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  81.15 
 
 
337 aa  525  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437885  normal  0.0124572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4590  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  78.14 
 
 
342 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1519  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  79.48 
 
 
335 aa  517  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.059232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2338  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  79.15 
 
 
335 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895899  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  59.88 
 
 
329 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3693  thiosulphate-binding protein  56.62 
 
 
332 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0325  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.18 
 
 
337 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.85 
 
 
341 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.74 
 
 
337 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  59.74 
 
 
337 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.05 
 
 
341 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.74 
 
 
337 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2992  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.55 
 
 
339 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2940  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.86 
 
 
363 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  55.69 
 
 
337 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2966  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.2 
 
 
339 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  53.82 
 
 
329 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  53.64 
 
 
341 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45110  sulfate-binding protein of ABC transporter  56.35 
 
 
332 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2331  thiosulphate-binding protein  59.87 
 
 
339 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2945  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.87 
 
 
339 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2855  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.21 
 
 
339 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3839  sulfate-binding protein of ABC transporter  55.7 
 
 
332 aa  362  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6297  ABC thiosulphate transporter, periplasmic ligand binding protein  59.21 
 
 
339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.74 
 
 
329 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  52.91 
 
 
329 aa  358  9e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.52 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  54.13 
 
 
329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  54.86 
 
 
327 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  55.13 
 
 
338 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.29 
 
 
356 aa  354  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  52.89 
 
 
332 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.07 
 
 
339 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.07 
 
 
339 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  54.23 
 
 
329 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  56.23 
 
 
336 aa  348  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4305  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.05 
 
 
332 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3632  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.05 
 
 
332 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  55.76 
 
 
335 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3870  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.72 
 
 
332 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.63 
 
 
337 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.63 
 
 
359 aa  346  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3383  extracellular solute-binding protein  54.4 
 
 
341 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  54.79 
 
 
328 aa  346  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.98 
 
 
341 aa  345  7e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  57.93 
 
 
335 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2760  thiosulphate-binding protein  52.91 
 
 
329 aa  344  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  52.31 
 
 
331 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  56.07 
 
 
346 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1781  thiosulphate-binding protein  54.55 
 
 
344 aa  342  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.77 
 
 
331 aa  341  8e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  58.69 
 
 
345 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.69 
 
 
345 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.36 
 
 
345 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  50.3 
 
 
330 aa  339  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30540  Sulfate ABC transporter-binding component-CysP-like protein  53.73 
 
 
332 aa  339  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  47.29 
 
 
335 aa  338  9e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.21 
 
 
337 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.46 
 
 
345 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.58 
 
 
351 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.46 
 
 
345 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4739  thiosulphate-binding protein  58.36 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623695  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1578  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.36 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3625  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.34 
 
 
332 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.58 
 
 
337 aa  335  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  51.38 
 
 
329 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.38 
 
 
329 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0122  thiosulfate binding protein  57.28 
 
 
337 aa  334  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964738  decreased coverage  0.00000712106 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  51.38 
 
 
329 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  51.38 
 
 
329 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  51.38 
 
 
329 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  51.38 
 
 
329 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  51.38 
 
 
329 aa  334  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1209  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.7 
 
 
327 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2013  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.7 
 
 
345 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1861  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.7 
 
 
345 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  51.38 
 
 
329 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1698  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  57.7 
 
 
345 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0701208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1847  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.7 
 
 
345 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1196  sulfate ABC transporter, sulfate/thiosulfate-binding protein  52.24 
 
 
351 aa  332  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  52.24 
 
 
351 aa  332  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1565  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.25 
 
 
332 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105023  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2480  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.7 
 
 
345 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1044  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.32 
 
 
336 aa  332  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2345  thiosulphate-binding protein  53.07 
 
 
342 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6842  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.62 
 
 
337 aa  331  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2077  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.05 
 
 
341 aa  331  8e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000402733  hitchhiker  0.00000000000000351214 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0806  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  57.38 
 
 
345 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0354  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  57.38 
 
 
345 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.271086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0241  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.48 
 
 
331 aa  330  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.276521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  53.44 
 
 
337 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.19 
 
 
338 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2981  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.87 
 
 
345 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  51.08 
 
 
329 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  51.39 
 
 
329 aa  328  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>