30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0630 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0630  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 473 aa  958    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0480  putative phytochrome sensor protein  63.68 
 
 		 448 aa  532  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3714  putative GAF sensor protein  63.89 
 
 		 448 aa  531  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.865149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0055  GAF:pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  56.96 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0350  putative GAF sensor protein  51.88 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3699  hypothetical protein  51.55 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3048  putative GAF sensor protein  42.31 
 
 		 467 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2916  putative GAF sensor protein  41.38 
 
 		 450 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.11422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3146  putative phytochrome sensor protein  41.91 
 
 		 466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3247  putative phytochrome sensor protein  42.32 
 
 		 466 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1553  putative GAF sensor protein  37.83 
 
 		 448 aa  269  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00827304  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1045  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.55 
 
 		 134 aa  53.5  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0950451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0503  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  22.64 
 
 		 760 aa  53.5  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0356191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0428  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  26.16 
 
 		 754 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2414  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  26.26 
 
 		 756 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1041  diguanylate cyclase  21.57 
 
 		 791 aa  50.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1657  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.92 
 
 		 134 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 		 1479 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004430  phosphocarrier protein kinase/phosphorylase nitrogen regulation associated  24.28 
 
 		 748 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000755885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0439  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  24.28 
 
 		 766 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.293101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 911 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1734  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  24.28 
 
 		 759 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1441  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.88 
 
 		 134 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0293  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.38 
 
 		 132 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1132  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.3 
 
 		 134 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.492287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3845  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  24.42 
 
 		 762 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 905 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0462  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.56 
 
 		 134 aa  43.5  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1426  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.09 
 
 		 133 aa  43.5  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  0.0247628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0397  PTSINtr with GAF domain, PtsP  24.66 
 
 		 755 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330427  normal  0.719594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>