38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5559 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 152 aa  304  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  76.35 
 
 		 151 aa  222  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1128  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  62.5 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.27 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.27 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.27 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.27 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.27 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.27 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.4 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.89 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.01 
 
 		 153 aa  139  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.44 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.19 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.41 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.52 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.81 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.56 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.77 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.27 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.4 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1162  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.35 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10032  ATP synthase delta chain, mitochondrial precursor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03100)  24.71 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0262441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.76 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.56 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.52 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.88 
 
 		 140 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.42 
 
 		 140 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.48 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  32.04 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.26 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.87 
 
 		 139 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>