106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5466 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5466  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310164  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1144  hypothetical protein  86.27 
 
 
102 aa  169  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461512  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5222  hypothetical protein  60.78 
 
 
98 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.41743  normal  0.189967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  45.54 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1187  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1494  hypothetical protein  49.12 
 
 
93 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6335  hypothetical protein  49.12 
 
 
93 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30067  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  45.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  44.55 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  50.88 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  42.27 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7000  hypothetical protein  45.45 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  51.79 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  63.16 
 
 
110 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  63.16 
 
 
110 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3772  hypothetical protein  56.9 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.685577  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  63.16 
 
 
110 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  63.16 
 
 
110 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  63.16 
 
 
110 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  63.16 
 
 
110 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4246  hypothetical protein  56.9 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0400746  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2180  hypothetical protein  63.16 
 
 
114 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483956  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  42.05 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  53.33 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3286  hypothetical protein  62.5 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  53.33 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3802  hypothetical protein  62.5 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  47.37 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  45 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  47.17 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5707  hypothetical protein  33.06 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6071  hypothetical protein  33.06 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.939472  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  43.18 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  69.57 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4458  hypothetical protein  61.4 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3908  hypothetical protein  61.4 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3619  hypothetical protein  61.4 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  47.37 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7182  hypothetical protein  48.91 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.11331  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  46.59 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4675  hypothetical protein  61.4 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128716  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  53.7 
 
 
102 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  53.7 
 
 
102 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  53.7 
 
 
102 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  53.7 
 
 
102 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1394  hypothetical protein  38.2 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0346066  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  53.41 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4004  hypothetical protein  56.9 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719576  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5983  hypothetical protein  38.46 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667618  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4363  hypothetical protein  56.9 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60678  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  53.7 
 
 
116 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  53.7 
 
 
116 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  53.7 
 
 
116 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4258  hypothetical protein  56.9 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357148  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5991  hypothetical protein  56.9 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.982912  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3274  hypothetical protein  38.37 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0310372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  38.46 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4386  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0091  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  48.21 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  48.21 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  48.21 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4855  hypothetical protein  49.09 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1105  hypothetical protein  39.08 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2718  hypothetical protein  39.08 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  45.61 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  45.61 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1657  hypothetical protein  56.9 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148111  normal  0.110028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  51.14 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  45.61 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  45.61 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  45.61 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  45.61 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  45.61 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  45.61 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5402  hypothetical protein  49.09 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440332  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5739  hypothetical protein  38.6 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380293  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  48.21 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  39.82 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  37.27 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  42.16 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  37.27 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5531  hypothetical protein  50.88 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4741  hypothetical protein  50.88 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  42.16 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  63.16 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3205  hypothetical protein  41.18 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5162  hypothetical protein  41.18 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238129  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6555  hypothetical protein  30.58 
 
 
113 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831358  normal  0.817546 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5117  hypothetical protein  41.18 
 
 
114 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1633  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5201  hypothetical protein  45.61 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487979  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4879  hypothetical protein  41.38 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00122865  normal  0.244901 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>