25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3048 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  93.2 
 
 		 147 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  77.55 
 
 		 143 aa  233  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  65.54 
 
 		 144 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  65.54 
 
 		 144 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  65.99 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  65.75 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  55.3 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  55.64 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  50.34 
 
 		 165 aa  140  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  48.3 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0421  hypothetical protein  42.96 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244801  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0118  hypothetical protein  41.38 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000449189  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4776  conserved hypothetical signal peptide protein  35.86 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3699  putative signal peptide protein  35.86 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356109 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1161  excinuclease ATPase subunit  40.56 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000979221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3907  hypothetical protein  45.53 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2170  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.73 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0418  hypothetical protein  32.64 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.63884  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_003296  RS00762  putative signal peptide protein  28.1 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.44153  normal  0.410048 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4088  putative signal peptide protein  29.59 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  0.930928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3613  putative signal peptide protein  29.59 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0705  putative signal peptide protein  30.33 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3049  conserved hypothetical signal peptide protein  28.57 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0304296  normal  0.277208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0942  hypothetical protein  28.83 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00804461  normal  0.623642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>