29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0096 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0096    100 
 
 		 588 bp  1166    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  86.79 
 
 		 2013 bp  303  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  86.79 
 
 		 2013 bp  303  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  85.96 
 
 		 2013 bp  295  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  86.24 
 
 		 2013 bp  283  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  86.11 
 
 		 2031 bp  278  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  86.11 
 
 		 2031 bp  278  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0644    83.33 
 
 		 5236 bp  218  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.129883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  82.75 
 
 		 2016 bp  202  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  82.46 
 
 		 2016 bp  194  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  82.16 
 
 		 2016 bp  186  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  82.18 
 
 		 2001 bp  165  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  80.75 
 
 		 2016 bp  151  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  80.73 
 
 		 2013 bp  129  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0558  DNA topoisomerase III  89.71 
 
 		 2043 bp  79.8  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 621 bp  60  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7425  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  58  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.744352 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7257  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 528 bp  58  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  92.5 
 
 		 2556 bp  56  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5179  integrase family protein  100 
 
 		 1518 bp  52  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  86.79 
 
 		 1968 bp  50.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  86.79 
 
 		 1965 bp  50.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  96.55 
 
 		 1968 bp  50.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  90.24 
 
 		 1965 bp  50.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3364  DNA topoisomerase III  85.96 
 
 		 1944 bp  50.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0283  DNA topoisomerase III  91.67 
 
 		 2055 bp  48.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1425  DNA topoisomerase III  91.67 
 
 		 2052 bp  48.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.771336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1738  DNA topoisomerase III  91.67 
 
 		 2100 bp  48.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  100 
 
 		 1557 bp  48.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.389525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>