More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7354 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7354  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
105 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3165  transposase IS3/IS911 family protein  86.67 
 
 
105 aa  190  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897924  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3633  transposase IS3/IS911 family protein  85.71 
 
 
112 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996449  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0617  transposase IS3/IS911 family protein  64.58 
 
 
106 aa  122  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.599694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3994  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 
111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
95 aa  115  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
95 aa  115  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
95 aa  115  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5597  transposase IS3/IS911 family protein  60.95 
 
 
111 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4007  transposase IS3/IS911 family protein  60.95 
 
 
111 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  47.19 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1315  transposase IS3/IS911 family protein  48.42 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0494436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0153  transposase IS3/IS911 family protein  48.42 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0980  transposase IS3/IS911 family protein  48.42 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.571542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0520  transposase IS3/IS911 family protein  48.42 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0302  transposase IS3/IS911 family protein  48.42 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0981  transposase IS3/IS911 family protein  48.42 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.267655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1774  transposase IS3/IS911 family protein  48.42 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0550  transposase IS3/IS911 family protein  48.91 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  46.24 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1973  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  44.44 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  41.3 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  41.3 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1320  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  43.62 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06580  Transposase  39.53 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0602807  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  40.22 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0678  transposase IS3/IS911 family protein  45.74 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  39.08 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  39.08 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  39.08 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  39.08 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  39.08 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  39.08 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  41.98 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  38.37 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  38.14 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  38.37 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1228  ISSdy1, transposase OrfA  34.07 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000245829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0719  transposase orfA, IS3 family  42.06 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.854293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17910  Transposase  40 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.252162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0287  transposase  32.58 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  34.74 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  34.74 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  34.74 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  34.74 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  34.74 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  34.74 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  34.74 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3194  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960855  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  36.56 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  36.56 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  34.65 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  34.65 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0131  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4450  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.967947  normal  0.727343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2650  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.737543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2009  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0899439  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1119  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  34.65 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  34.65 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2005  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00032179  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  34.65 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>