More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2169 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  48.06 
 
 
645 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  58.38 
 
 
704 aa  824    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  54.51 
 
 
683 aa  710    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  55.17 
 
 
686 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  53.11 
 
 
680 aa  699    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  78.01 
 
 
682 aa  1110    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  58.14 
 
 
691 aa  806    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  54.52 
 
 
699 aa  698    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  61.93 
 
 
714 aa  897    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  54.73 
 
 
690 aa  713    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  54.56 
 
 
678 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  53.55 
 
 
690 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  58.24 
 
 
802 aa  796    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  56.43 
 
 
678 aa  749    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  53.55 
 
 
738 aa  701    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  52.8 
 
 
684 aa  683    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  53.25 
 
 
680 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  54.75 
 
 
679 aa  708    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  54.88 
 
 
690 aa  717    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  74.82 
 
 
716 aa  1068    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  53.25 
 
 
680 aa  706    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  55.62 
 
 
681 aa  717    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.48 
 
 
682 aa  694    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  53.73 
 
 
680 aa  708    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  55.26 
 
 
679 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  100 
 
 
685 aa  1419    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  62.1 
 
 
689 aa  890    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  53.86 
 
 
687 aa  727    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  60.41 
 
 
692 aa  845    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  53.43 
 
 
681 aa  702    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  56.28 
 
 
679 aa  730    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  53.25 
 
 
680 aa  706    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  53.97 
 
 
680 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  60.67 
 
 
686 aa  852    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  47.6 
 
 
642 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  43.95 
 
 
647 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  44.53 
 
 
647 aa  548  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  42.49 
 
 
635 aa  547  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  42.49 
 
 
635 aa  545  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  44.63 
 
 
652 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  44.51 
 
 
676 aa  513  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  43.86 
 
 
644 aa  506  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  55.83 
 
 
846 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  32.07 
 
 
650 aa  289  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  30.64 
 
 
600 aa  270  4e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  30.29 
 
 
587 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  29 
 
 
576 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  27.49 
 
 
583 aa  174  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  29 
 
 
576 aa  173  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.35 
 
 
573 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.71 
 
 
566 aa  169  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.06 
 
 
566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.35 
 
 
566 aa  163  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.24 
 
 
577 aa  156  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  25.45 
 
 
700 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  28.37 
 
 
567 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  25.24 
 
 
575 aa  152  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  25.88 
 
 
574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  26.8 
 
 
686 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  26.79 
 
 
611 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  27.34 
 
 
554 aa  146  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  27.73 
 
 
539 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  26.88 
 
 
554 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  28.24 
 
 
552 aa  145  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  27.94 
 
 
561 aa  145  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  27.66 
 
 
598 aa  144  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  25.38 
 
 
688 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.17 
 
 
542 aa  142  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  27.45 
 
 
554 aa  141  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  25.99 
 
 
542 aa  140  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  25.37 
 
 
658 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.37 
 
 
577 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.6 
 
 
543 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  25.65 
 
 
559 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.9 
 
 
577 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  29.51 
 
 
571 aa  138  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  26.76 
 
 
571 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.2 
 
 
597 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  27.35 
 
 
584 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  26.73 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  27.19 
 
 
562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  27.4 
 
 
550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  26.86 
 
 
556 aa  135  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  24.96 
 
 
545 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  26.36 
 
 
564 aa  135  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  27.39 
 
 
548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  26.7 
 
 
565 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  23.09 
 
 
561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  25.14 
 
 
540 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  25.14 
 
 
540 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  25.51 
 
 
538 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  25.14 
 
 
540 aa  131  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  27.84 
 
 
590 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  28.3 
 
 
599 aa  130  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  25.49 
 
 
540 aa  130  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  27.06 
 
 
591 aa  128  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  26.05 
 
 
582 aa  128  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  26.45 
 
 
577 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  24.78 
 
 
561 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  27.86 
 
 
549 aa  127  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>