25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0706 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  78.23 
 
 		 147 aa  231  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  77.55 
 
 		 147 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  67.36 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  67.36 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  68.06 
 
 		 144 aa  180  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  67.83 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  58.39 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  53.47 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  53.15 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  46.04 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0421  hypothetical protein  43.36 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244801  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1161  excinuclease ATPase subunit  40.58 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000979221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3907  hypothetical protein  43.2 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0118  hypothetical protein  45.45 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000449189  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2170  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.44 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4776  conserved hypothetical signal peptide protein  33.81 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3699  putative signal peptide protein  33.81 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0705  putative signal peptide protein  32.88 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0418  hypothetical protein  34.04 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.63884  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_003296  RS00762  putative signal peptide protein  30.71 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.44153  normal  0.410048 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4088  putative signal peptide protein  29.66 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  0.930928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3613  putative signal peptide protein  29.59 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0942  hypothetical protein  26.76 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00804461  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3049  conserved hypothetical signal peptide protein  26.57 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0304296  normal  0.277208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>