36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2360 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  732    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.03 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  24.63 
 
 
334 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  24.8 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.4 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.51 
 
 
327 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  25.3 
 
 
332 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  25.09 
 
 
379 aa  87  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.95 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  28.74 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  27.68 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  24.8 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  28.44 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.7 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  25.49 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  21.23 
 
 
331 aa  72  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.15 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  23.89 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  24.17 
 
 
354 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  24.17 
 
 
354 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  24.02 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  23.58 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  23.47 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  23.91 
 
 
368 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  33.91 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  19.9 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  25.18 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  21.79 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  22.53 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  22.33 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  28.77 
 
 
364 aa  47  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  23.39 
 
 
367 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  26.39 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  25 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  22.9 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  22.9 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>