More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0543 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  100 
 
 		 660 aa  1335    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  55.32 
 
 		 642 aa  721    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  53.11 
 
 		 661 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  43.54 
 
 		 671 aa  545  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  43.67 
 
 		 688 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  42.47 
 
 		 669 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  42.62 
 
 		 667 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  43.61 
 
 		 683 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  43.35 
 
 		 683 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  42.96 
 
 		 696 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  42.94 
 
 		 681 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  42.62 
 
 		 670 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  42.75 
 
 		 699 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  42.38 
 
 		 682 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  43.27 
 
 		 678 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  42.68 
 
 		 678 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  44.44 
 
 		 655 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  43.65 
 
 		 686 aa  495  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  40.82 
 
 		 675 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  43.01 
 
 		 671 aa  485  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  41.88 
 
 		 678 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  42.1 
 
 		 680 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  41.73 
 
 		 678 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  38.92 
 
 		 688 aa  475  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  40.79 
 
 		 676 aa  469  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  40.12 
 
 		 662 aa  419  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4086  elongation factor G  36.24 
 
 		 653 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5899  elongation factor G  33.64 
 
 		 653 aa  347  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  32.59 
 
 		 695 aa  319  7.999999999999999e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.04 
 
 		 692 aa  311  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  33.93 
 
 		 691 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  32.1 
 
 		 696 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  31.52 
 
 		 683 aa  301  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.27 
 
 		 682 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  30.51 
 
 		 685 aa  299  1e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  31.82 
 
 		 692 aa  299  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  32.63 
 
 		 688 aa  298  3e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.16 
 
 		 691 aa  296  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  34.1 
 
 		 695 aa  296  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  32.78 
 
 		 673 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  32.79 
 
 		 692 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  33.88 
 
 		 680 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  31.64 
 
 		 692 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  32.52 
 
 		 692 aa  292  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  32.03 
 
 		 689 aa  291  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  31.07 
 
 		 683 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  29.67 
 
 		 690 aa  290  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  30.18 
 
 		 694 aa  290  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  31.64 
 
 		 692 aa  290  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  33.33 
 
 		 690 aa  289  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  33.53 
 
 		 687 aa  289  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  32.63 
 
 		 694 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  32.63 
 
 		 694 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  32.41 
 
 		 697 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  30.96 
 
 		 673 aa  287  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  32.52 
 
 		 692 aa  287  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  31.82 
 
 		 692 aa  287  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  31.44 
 
 		 692 aa  286  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  31.66 
 
 		 692 aa  286  8e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  31.78 
 
 		 691 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  31.83 
 
 		 692 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  31.99 
 
 		 692 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  31.83 
 
 		 692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  31.83 
 
 		 692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  31.83 
 
 		 692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  33.23 
 
 		 686 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  31.83 
 
 		 692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  31.1 
 
 		 697 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  30.46 
 
 		 691 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  33.22 
 
 		 692 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  31.83 
 
 		 692 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  30.34 
 
 		 693 aa  284  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  31.83 
 
 		 692 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  32.21 
 
 		 691 aa  283  5.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0709  elongation factor G  32.51 
 
 		 706 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  29.57 
 
 		 694 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  31.9 
 
 		 685 aa  282  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  31.81 
 
 		 689 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  31.66 
 
 		 692 aa  282  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  31.13 
 
 		 679 aa  280  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  31.74 
 
 		 703 aa  280  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  31.3 
 
 		 696 aa  280  6e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  30.17 
 
 		 685 aa  279  9e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.78 
 
 		 700 aa  280  9e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  32.68 
 
 		 689 aa  280  9e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  31.32 
 
 		 692 aa  279  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  29.88 
 
 		 682 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  31.58 
 
 		 704 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  31.24 
 
 		 692 aa  278  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  32.34 
 
 		 687 aa  278  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  28.68 
 
 		 695 aa  278  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  32.4 
 
 		 695 aa  277  4e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  32.67 
 
 		 692 aa  277  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  31.9 
 
 		 707 aa  276  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  29.07 
 
 		 701 aa  276  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  31.21 
 
 		 692 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  31.86 
 
 		 704 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  27.69 
 
 		 696 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  33.82 
 
 		 707 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  31.4 
 
 		 704 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>