More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28360 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  48.53 
 
 
687 aa  664    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  100 
 
 
846 aa  1709    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.78 
 
 
682 aa  742    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  53.28 
 
 
684 aa  734    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  65.33 
 
 
681 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  67.4 
 
 
690 aa  497  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  66.85 
 
 
690 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  66.85 
 
 
690 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  66.03 
 
 
679 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  64.93 
 
 
679 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  38.02 
 
 
647 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  63.84 
 
 
699 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  62.24 
 
 
680 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  64.66 
 
 
679 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  62.24 
 
 
680 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  64.92 
 
 
680 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  62.24 
 
 
680 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  62.03 
 
 
680 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  65.51 
 
 
686 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  63.19 
 
 
683 aa  475  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  63.22 
 
 
680 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  64.62 
 
 
678 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  41.32 
 
 
676 aa  466  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  61.92 
 
 
738 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  58.9 
 
 
704 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  37.06 
 
 
647 aa  448  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  58.31 
 
 
691 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  59.3 
 
 
686 aa  442  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  59.08 
 
 
692 aa  435  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  59.13 
 
 
681 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  56.84 
 
 
682 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  57.26 
 
 
689 aa  426  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  55.97 
 
 
714 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  55.12 
 
 
716 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  58.5 
 
 
678 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  57.73 
 
 
802 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  55.83 
 
 
685 aa  406  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  36.42 
 
 
644 aa  380  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  48.4 
 
 
652 aa  330  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  48.44 
 
 
645 aa  318  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  47.65 
 
 
642 aa  312  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  45.07 
 
 
635 aa  307  7e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  44.51 
 
 
635 aa  305  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  39.35 
 
 
650 aa  242  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  36.67 
 
 
600 aa  204  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  28.62 
 
 
573 aa  114  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  30 
 
 
576 aa  107  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  30 
 
 
576 aa  107  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  30.92 
 
 
587 aa  105  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  31 
 
 
541 aa  104  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  27.15 
 
 
574 aa  102  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  34.1 
 
 
539 aa  102  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  29.77 
 
 
545 aa  102  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.14 
 
 
575 aa  102  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  32.23 
 
 
543 aa  100  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  32.06 
 
 
554 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  31.1 
 
 
582 aa  99.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  30.65 
 
 
556 aa  100  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  29.96 
 
 
556 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  28.12 
 
 
583 aa  96.3  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  30.45 
 
 
577 aa  95.5  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  29.59 
 
 
564 aa  94.7  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  29.04 
 
 
562 aa  93.6  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  29.48 
 
 
561 aa  93.6  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  29.19 
 
 
545 aa  92.4  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  30.77 
 
 
567 aa  92  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  28.78 
 
 
559 aa  92  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  30.77 
 
 
567 aa  91.7  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  29.76 
 
 
543 aa  91.7  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  32.1 
 
 
546 aa  91.3  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  27.65 
 
 
561 aa  90.9  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.91 
 
 
686 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  31.4 
 
 
554 aa  89.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  31.51 
 
 
554 aa  89.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  26.1 
 
 
700 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  28.93 
 
 
552 aa  89  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  30.77 
 
 
540 aa  88.6  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  26.87 
 
 
561 aa  88.2  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  28.09 
 
 
542 aa  87.8  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.62 
 
 
566 aa  87.8  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  32.67 
 
 
599 aa  87.8  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.09 
 
 
542 aa  87.8  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  31.54 
 
 
548 aa  87.4  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  31.03 
 
 
567 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  26.74 
 
 
557 aa  87  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  29.26 
 
 
577 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.54 
 
 
566 aa  87.4  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  28.73 
 
 
561 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  29.18 
 
 
566 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  30.36 
 
 
550 aa  86.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.81 
 
 
566 aa  85.9  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  26.61 
 
 
540 aa  85.9  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  29.74 
 
 
561 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  27.46 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  28.12 
 
 
571 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  28.05 
 
 
566 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  29.18 
 
 
576 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  26.1 
 
 
565 aa  85.1  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  30.08 
 
 
553 aa  85.1  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  30.52 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>