18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16860 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  43.1 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  46.15 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  38.1 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1138  hypothetical protein  43.14 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  47.06 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0833  hypothetical protein  49.02 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1943  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.605997  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  31.94 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  45.45 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  44.68 
 
 		 71 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  40.32 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  31.58 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  36.17 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>