More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.51 
 
 
514 aa  711    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.48 
 
 
510 aa  676    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3055  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.27 
 
 
505 aa  736    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171926 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16510  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.6 
 
 
514 aa  684    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00613898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2585  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.24 
 
 
507 aa  743    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4447  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.23 
 
 
501 aa  645    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07600  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.13 
 
 
498 aa  671    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.194742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08690  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
499 aa  1006    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0432795  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1899  IMP dehydrogenase/GMP reductase  67.48 
 
 
517 aa  695    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.25 
 
 
513 aa  637    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2587  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.01 
 
 
503 aa  692    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000196974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0687  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.74 
 
 
501 aa  731    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.559264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2879  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.76 
 
 
503 aa  700    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0154703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28670  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.15 
 
 
507 aa  751    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.36 
 
 
504 aa  723    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.29 
 
 
500 aa  743    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.46 
 
 
500 aa  633  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.1 
 
 
500 aa  627  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.13 
 
 
514 aa  627  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.46 
 
 
520 aa  621  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.14 
 
 
517 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515075  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.26 
 
 
520 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1167  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.14 
 
 
517 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1160  IMP dehydrogenase  64.69 
 
 
493 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1184  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.94 
 
 
517 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.87 
 
 
498 aa  611  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.27 
 
 
492 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.4 
 
 
495 aa  610  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4023  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.15 
 
 
498 aa  608  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836954  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.5 
 
 
516 aa  608  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6535  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.84 
 
 
503 aa  605  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1511  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.37 
 
 
517 aa  598  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1726  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.17 
 
 
503 aa  592  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13445  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.84 
 
 
529 aa  594  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0612971  normal  0.0362546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.09 
 
 
514 aa  591  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4909  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.9 
 
 
517 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.636899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0636  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.65 
 
 
537 aa  580  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5998  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.77 
 
 
597 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.89 
 
 
490 aa  545  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.75 
 
 
494 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.42 
 
 
486 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.25 
 
 
483 aa  530  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.44 
 
 
485 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  53.85 
 
 
488 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.94 
 
 
488 aa  523  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.53 
 
 
491 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  53.33 
 
 
488 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.95 
 
 
485 aa  521  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.8 
 
 
482 aa  518  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.42 
 
 
489 aa  521  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.59 
 
 
503 aa  517  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.35 
 
 
498 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.61 
 
 
491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  53.28 
 
 
484 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.59 
 
 
482 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.82 
 
 
497 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.36 
 
 
491 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.86 
 
 
487 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.58 
 
 
485 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.35 
 
 
508 aa  513  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.96 
 
 
504 aa  513  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.95 
 
 
491 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.14 
 
 
498 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.66 
 
 
484 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.69 
 
 
485 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.12 
 
 
484 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.64 
 
 
488 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.04 
 
 
488 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.45 
 
 
487 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.4 
 
 
485 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.62 
 
 
487 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.23 
 
 
486 aa  509  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.41 
 
 
487 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.73 
 
 
498 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.81 
 
 
496 aa  510  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.65 
 
 
487 aa  509  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.4 
 
 
498 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  52.43 
 
 
484 aa  510  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.45 
 
 
487 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.65 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.45 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.65 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.65 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.65 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.41 
 
 
487 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.59 
 
 
482 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.45 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.33 
 
 
498 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.83 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.13 
 
 
493 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.89 
 
 
485 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.68 
 
 
499 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.01 
 
 
486 aa  506  9.999999999999999e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.55 
 
 
489 aa  507  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.43 
 
 
493 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.44 
 
 
507 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.24 
 
 
487 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.71 
 
 
497 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.59 
 
 
486 aa  502  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.77 
 
 
504 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>