33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7560 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5448  hypothetical protein  77.92 
 
 		 808 aa  1232    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5001  hypothetical protein  77.97 
 
 		 815 aa  1277    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5570  hypothetical protein  77.68 
 
 		 816 aa  1289    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7560  hypothetical protein  100 
 
 		 811 aa  1617    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125475  normal  0.437403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.56 
 
 		 959 aa  77.8  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  26.89 
 
 		 956 aa  77  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.27 
 
 		 975 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  28.62 
 
 		 963 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  28.51 
 
 		 1240 aa  74.3  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.71 
 
 		 971 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.19 
 
 		 971 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  26.67 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  30.92 
 
 		 788 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25 
 
 		 811 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.72 
 
 		 867 aa  54.7  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  28 
 
 		 359 aa  52  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  22.49 
 
 		 1097 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  26.04 
 
 		 462 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  22.66 
 
 		 891 aa  51.2  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  24.93 
 
 		 842 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.2 
 
 		 797 aa  50.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2557  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  29.73 
 
 		 631 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  24.93 
 
 		 842 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  26.12 
 
 		 462 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  26.98 
 
 		 791 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  28.45 
 
 		 826 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.92 
 
 		 386 aa  48.9  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  29.87 
 
 		 726 aa  48.5  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  25.85 
 
 		 785 aa  48.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  23.27 
 
 		 334 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 287 aa  46.2  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 290 aa  45.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  26.98 
 
 		 837 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>