20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7248 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7248  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  320  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148646  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  34.48 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  34.48 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  34.48 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  34.83 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  35.63 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  33.71 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  28.21 
 
 
226 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  35.63 
 
 
134 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  30.85 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  36.46 
 
 
136 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  28.95 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  28.03 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  31.46 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  30.28 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3647  protein of unknown function DUF1311  32.91 
 
 
140 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412163 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  28.74 
 
 
133 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  32.98 
 
 
134 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  27.59 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  31.03 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>