38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7205 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7205  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 68 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699567  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6788  Flp/Fap pilin component  79.41 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.234531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5502  Flp/Fap pilin component  79.41 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253434  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6376  Flp/Fap pilin component  79.41 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465787 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6288  Flp/Fap pilin component  71.93 
 
 		 68 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0180675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5992  Flp/Fap pilin component  58.21 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  53.06 
 
 		 56 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  38.33 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  36.54 
 
 		 52 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  35.59 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3825  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 		 55 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  39.66 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  32.08 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  32.69 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  36.54 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2640  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  30.91 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  47.73 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  35 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  36.07 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  35.29 
 
 		 72 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  37.04 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  29.31 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  35.09 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  36.17 
 
 		 48 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  36.17 
 
 		 48 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  37.04 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  37.04 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  37.04 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  38 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  33.33 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>