299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_AR0082 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_AR0082  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2797  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02241  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000057797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0006  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0354  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.570155  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0062  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0136  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.740325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0075  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283393  normal  0.209265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0018  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0021  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0075  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0049  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000790035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0159  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2361  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.979776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0169  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0070  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00525701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0075  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0072  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0389238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2283  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00760405  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0058  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0003  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0056  tRNA-Phe  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0060  tRNA-Phe  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0028  tRNA-Phe  98.31 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748301  normal  0.0311431 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0001  tRNA-Phe  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  98.21 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  98.21 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0005  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0005  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0043  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0046  tRNA-Phe  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0054  tRNA-Phe  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t03  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0015  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0004  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0014  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.58788  hitchhiker  0.00239858 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4333  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0560491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0029  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0034  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000955426  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0113  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0264  tRNA-Phe  98.04 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00100178  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0028  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000645799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0046  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0005  tRNA-Phe  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.497838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0066  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0346272  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4594  tRNA-Phe  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0010  tRNA-Phe  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0069  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0007  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0059  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0006  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0062  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.205549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60620  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.787941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0076  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  hitchhiker  0.00000000192681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5887  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60610  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.820326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68030  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351538  hitchhiker  0.008643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00055  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00056658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00079  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0014  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4271  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0065  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0079  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3366  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557417  normal  0.506535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0021  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811173  normal  0.0253412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3111  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0206196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0011  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3610  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4603  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000814099  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4722  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00159768  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0044  tRNA-Phe  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4739  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4682  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0066  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0398911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0044  tRNA-Phe  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0044  tRNA-Phe  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3358  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0011  tRNA-Phe  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443176  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0161  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129088 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna30  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.319262  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3292  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3281  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4591  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.441265  normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4698  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4599  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5108  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5068  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0733  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00229797  decreased coverage  0.0082117 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4717  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0037  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0083  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0016  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0448641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>