16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4707 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4707  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4729  hypothetical protein  75.8 
 
 
423 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597904  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1072  hypothetical protein  61.11 
 
 
423 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0463115  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4972  hypothetical protein  36.59 
 
 
420 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990538  normal  0.205743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2515  hypothetical protein  36.03 
 
 
420 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2297  hypothetical protein  32.09 
 
 
420 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.500408  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0050  hypothetical protein  30.64 
 
 
443 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35800  hypothetical protein  32.1 
 
 
438 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149745  decreased coverage  5.600339999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3060  hypothetical protein  32.1 
 
 
438 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3721  hypothetical protein  28.25 
 
 
425 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.631382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1965  hypothetical protein  26.11 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24813  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3370  hypothetical protein  24.72 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2194  hypothetical protein  20.23 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2716  hypothetical protein  25.72 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.382449  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0736  hypothetical protein  23.45 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0710  hypothetical protein  20.83 
 
 
387 aa  42.7  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000886213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>