45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0720 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0720  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3838  hypothetical protein  84.21 
 
 		 141 aa  249  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0751  hypothetical protein  90.79 
 
 		 147 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0267  hypothetical protein  90.79 
 
 		 147 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0668  hypothetical protein  82.89 
 
 		 146 aa  233  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0645  hypothetical protein  80.92 
 
 		 146 aa  228  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2634  hypothetical protein  90.91 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3962  putative thioredoxin protein  80.65 
 
 		 148 aa  204  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2498  putative thioredoxin protein  79.83 
 
 		 143 aa  199  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1307  hypothetical protein  80.7 
 
 		 143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3312  thioredoxin family protein  73.57 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2207  hypothetical protein  74.29 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0499  hypothetical protein  74.29 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1100  hypothetical protein  74.29 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3323  hypothetical protein  74.29 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3279  thioredoxin family protein  74.29 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0785061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2327  hypothetical protein  74.29 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1005  putative thioredoxin protein  66.1 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1041  putative thioredoxin protein  66.67 
 
 		 141 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2638  putative thioredoxin protein  66.67 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.566673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2467  putative thioredoxin protein  70 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2873  putative thioredoxin protein  69.17 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  25.27 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  28.71 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  30.77 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  25 
 
 		 104 aa  44.3  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0859  Thioredoxin domain protein  26.13 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  31.62 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2654  thioredoxin-related protein  34.29 
 
 		 370 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.540425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  26.47 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  27.96 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  28.95 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0626  Thioredoxin domain protein  30.43 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1825  Thioredoxin domain protein  27.03 
 
 		 108 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  26.04 
 
 		 104 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  25.64 
 
 		 104 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  26.88 
 
 		 105 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0241  Thioredoxin domain protein  29.35 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.83806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  27.18 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  30.68 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  27.72 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  31.37 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  23.4 
 
 		 107 aa  40  0.01  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  28.71 
 
 		 108 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>