38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3664 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3664  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
230 aa  464  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.753638  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  25 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 
176 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4423  Phosphoglycerate mutase  26.26 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.120144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
221 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.98 
 
 
170 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  39.76 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  39.76 
 
 
229 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  39.76 
 
 
229 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  39.76 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2062  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
229 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.792733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  40.74 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  35 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  42.68 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  30.9 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  25.6 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
223 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0934  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.11 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
220 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>