21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3212 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  100 
 
 
463 aa  861    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  27.74 
 
 
556 aa  94  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  37.1 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  37.61 
 
 
537 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0963  forkhead domain protein  34.82 
 
 
210 aa  67  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  35 
 
 
451 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  31.87 
 
 
668 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04060  uncharacterized conserved protein, contains FHA domain  34.74 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00580862  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0455  FHA domain containing protein  35.24 
 
 
125 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107862  normal  0.788327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
511 aa  56.6  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  28.38 
 
 
2272 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1340  FHA domain containing protein  34.26 
 
 
479 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.335677  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05580  FHA domain-containing protein  33.67 
 
 
128 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  34.56 
 
 
137 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1473  Forkhead-associated protein  31.97 
 
 
485 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0144762  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  27.93 
 
 
181 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  33.98 
 
 
221 aa  47.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1397  FHA domain containing protein  30.63 
 
 
512 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0172432  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1326  FHA domain containing protein  30.84 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.375936  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0737  FHA domain-containing protein  29.36 
 
 
498 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  hitchhiker  0.00771309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5899  hypothetical protein  31.13 
 
 
471 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529842  normal  0.0437244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>