27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3085 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3085  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
309 aa  595  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  0.971754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2360  aminoglycoside phosphotransferase  36.51 
 
 
314 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0130  aminoglycoside phosphotransferase  29.51 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.670297  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  31.15 
 
 
292 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  31.15 
 
 
292 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  31.93 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  31.15 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  35.71 
 
 
292 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  35.71 
 
 
293 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  31.09 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  43.28 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  37.84 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  37.89 
 
 
287 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  43.33 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  36.47 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  35.45 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  41.18 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  33.7 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  39.56 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  36.56 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  32 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  39.29 
 
 
534 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  31.62 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  42.42 
 
 
293 aa  42.7  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  37.5 
 
 
320 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>