19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2750 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2750  putative integral membrane transport protein  100 
 
 
542 aa  1006    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36100  hypothetical protein  38.42 
 
 
528 aa  256  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0679941  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0944  hypothetical protein  35.93 
 
 
532 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2591  hypothetical protein  36.83 
 
 
523 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0975  hypothetical protein  43.3 
 
 
518 aa  225  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16467  hitchhiker  0.00124053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2323  hypothetical protein  39.23 
 
 
523 aa  225  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26400  hypothetical protein  35.74 
 
 
575 aa  207  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23120  hypothetical protein  32.42 
 
 
570 aa  179  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4501  hypothetical protein  31.23 
 
 
560 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.263243 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08260  hypothetical protein  33.39 
 
 
533 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5013  hypothetical protein  29.62 
 
 
559 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07180  hypothetical protein  33.76 
 
 
529 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.685735  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1844  hypothetical protein  26.94 
 
 
557 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3106  hypothetical protein  32.84 
 
 
534 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000141938  hitchhiker  0.000284669 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1136  hypothetical protein  25.04 
 
 
550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1322  hypothetical protein  31.72 
 
 
539 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.322613  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3073  ABC transporter permease protein  27.33 
 
 
533 aa  64.3  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00508741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2865  hypothetical protein  27.51 
 
 
526 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0216967  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2590  hypothetical protein  22.78 
 
 
618 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>