28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6360 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 		 244 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  85.66 
 
 		 244 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  84.43 
 
 		 244 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  84.08 
 
 		 260 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  84.08 
 
 		 260 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  75.41 
 
 		 244 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  72.8 
 
 		 239 aa  358  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  40.26 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  39.83 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.19 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.17 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.85 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.87 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  27.69 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  31.2 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.2 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.91 
 
 		 117 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4843  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.18 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.77141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  30.77 
 
 		 123 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  30.93 
 
 		 119 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5735  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6488  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  34.82 
 
 		 114 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  34.82 
 
 		 114 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  32.97 
 
 		 115 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.65 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.32 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.77 
 
 		 119 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>