22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6543 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6543  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  782    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5573  hypothetical protein  78.78 
 
 		 380 aa  620  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  32.76 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.79 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.12 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.12 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  28.61 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  29.65 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  32.29 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  28.23 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  25.54 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  30.17 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  28.76 
 
 		 575 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  30.85 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  32.26 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  27.89 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  33.33 
 
 		 777 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  26.98 
 
 		 296 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  40.82 
 
 		 895 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>