36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3427 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 72 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4438  4-oxalocrotonate tautomerase  98.61 
 
 		 72 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  95.83 
 
 		 72 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  95.83 
 
 		 72 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  62.5 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4689  4-oxalocrotonate tautomerase  61.43 
 
 		 70 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.091228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  57.14 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 74 aa  80.1  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  49.18 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2693  4-oxalocrotonate tautomerase  34.29 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.46733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  43.08 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4696  4-oxalocrotonate tautomerase  38.24 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  hitchhiker  0.00079321 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  45.9 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  40.91 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4665  4-oxalocrotonate tautomerase  44.26 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  35.21 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.34 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2694  putative tautomerase  29.58 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0593084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  34.33 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  35.82 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 62 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  32.81 
 
 		 67 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  26.87 
 
 		 67 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 66 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 66 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  29.17 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  38.6 
 
 		 62 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  31.15 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  28.36 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  33.85 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  32.35 
 
 		 66 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>