15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3188 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3188  hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1123    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1341  hypothetical protein  52.95 
 
 
558 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1522  hypothetical protein  51.01 
 
 
562 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0853497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3068  chromosome segregation ATPase  46.24 
 
 
475 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.0733168 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  43.36 
 
 
509 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  37.13 
 
 
441 aa  224  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1847  chromosome segregation ATPase  44.6 
 
 
482 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0777  hypothetical protein  43.75 
 
 
354 aa  209  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21538  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1291  chromosome segregation ATPase  43.54 
 
 
469 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0081  hypothetical protein  47.09 
 
 
463 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0832  hypothetical protein  36.05 
 
 
431 aa  180  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6245  putative ATPase  35.29 
 
 
443 aa  146  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162013  normal  0.387295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  43.9 
 
 
457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  47.22 
 
 
450 aa  130  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2419  hypothetical protein  35.71 
 
 
147 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.0517279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>