35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1647 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  360  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  93.71 
 
 		 180 aa  287  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  83.24 
 
 		 178 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  82.69 
 
 		 180 aa  237  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  82.69 
 
 		 180 aa  237  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  81.53 
 
 		 181 aa  236  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  81.76 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  73.28 
 
 		 171 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  71.76 
 
 		 314 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  71.76 
 
 		 171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  55.49 
 
 		 171 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  60.69 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  59.72 
 
 		 171 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  36.67 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  40.87 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  43.62 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  43.62 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  37.23 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  30.84 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  31.96 
 
 		 106 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  32.37 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2312  hypothetical protein  31.58 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2447  hypothetical protein  30.08 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  30 
 
 		 231 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  30.21 
 
 		 230 aa  45.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0888  hypothetical protein  29.59 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  27.56 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  27.56 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  27.56 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3388  hypothetical protein  27.82 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0582  hypothetical protein  26.92 
 
 		 222 aa  41.2  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  26.89 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  27.84 
 
 		 210 aa  40.8  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>