28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0905 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2168  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  460  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402805  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0905  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  460  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584625  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0813  hypothetical protein  99.59 
 
 
241 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  52.44 
 
 
227 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  50.85 
 
 
240 aa  224  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  50.84 
 
 
240 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  51.26 
 
 
240 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  47.9 
 
 
241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  50.83 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1761  hypothetical protein  40.74 
 
 
156 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.758553  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  29.07 
 
 
248 aa  98.6  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  26.97 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  26.34 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  26.07 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  26.5 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2278  hypothetical protein  28.51 
 
 
258 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0545786  normal  0.385005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  24.31 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  28.24 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  27.54 
 
 
245 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6731  protein of unknown function DUF81  25.89 
 
 
344 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  28.65 
 
 
254 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  25.63 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  24.9 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  25.29 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  24.9 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  24.42 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  24.29 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  25.63 
 
 
253 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>