More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0780 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0780  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
1039 aa  2027    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1134  putative leucyl-tRNA synthetase  99.41 
 
 
734 aa  1024    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1209  putative leucyl-tRNA synthetase  99.41 
 
 
734 aa  1024    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2411  leucyl-tRNA synthetase  99.41 
 
 
734 aa  1025    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0687  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2412  hypothetical protein  99.35 
 
 
306 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1210  hypothetical protein  99.35 
 
 
306 aa  599  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1135  hypothetical protein  98.69 
 
 
306 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 
819 aa  336  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
824 aa  336  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
824 aa  332  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 
829 aa  328  5e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  31 
 
 
826 aa  324  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
851 aa  323  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
862 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
810 aa  321  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0682  leucyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 
930 aa  320  1e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.63979  normal  0.105643 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 
829 aa  319  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
824 aa  317  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
906 aa  317  7e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
829 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 
817 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
831 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
824 aa  315  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
834 aa  314  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 
823 aa  313  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1056  leucyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
599 aa  313  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373347  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  31 
 
 
828 aa  311  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
889 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
871 aa  311  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 
824 aa  311  5e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
824 aa  310  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1095  leucyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
877 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.768167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 
825 aa  310  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
861 aa  308  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
864 aa  308  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
868 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 
824 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 
856 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
877 aa  306  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3454  leucyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 
814 aa  305  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0244  leucyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
607 aa  305  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1807  leucyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
877 aa  305  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 
856 aa  305  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1740  leucyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
894 aa  305  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.723566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
827 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1446  leucyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
894 aa  304  7.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 
859 aa  303  8.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
858 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
868 aa  302  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
865 aa  302  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 
865 aa  302  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
815 aa  302  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
854 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 
813 aa  302  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
813 aa  301  4e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 
882 aa  301  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
865 aa  301  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
872 aa  301  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
823 aa  300  7e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 
818 aa  300  8e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1202  leucyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
875 aa  300  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 
906 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 
868 aa  300  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 
929 aa  300  9e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 
868 aa  300  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 
823 aa  300  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1322  leucyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
815 aa  300  1e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1858  leucyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
875 aa  298  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.663108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
868 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
868 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
874 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
859 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000277445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
874 aa  298  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 
859 aa  298  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
829 aa  297  6e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 
863 aa  297  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 
859 aa  297  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 
830 aa  296  9e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 
823 aa  296  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 
859 aa  296  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 
859 aa  296  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 
859 aa  296  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1579  leucyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 
901 aa  296  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  0.048228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 
874 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 
813 aa  296  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
829 aa  295  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
863 aa  295  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
859 aa  295  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
848 aa  295  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
857 aa  294  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0901  leucyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
919 aa  294  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 
825 aa  294  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
837 aa  294  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 
857 aa  293  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000807673  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
887 aa  293  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2911  leucyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 
832 aa  293  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.084861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
868 aa  292  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2819  leucyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
832 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
864 aa  291  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>