39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B1813 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1813  putative RNA polymerase sigma factor SigI  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3433  putative RNA polymerase sigma factor SigI  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3204  putative RNA polymerase sigma factor SigI  97.07 
 
 
240 aa  454  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0084081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3122  putative RNA polymerase sigma factor SigI  94.56 
 
 
240 aa  454  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3231  putative RNA polymerase sigma factor SigI  96.65 
 
 
240 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.625131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3483  putative RNA polymerase sigma factor SigI  96.65 
 
 
240 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3445  putative RNA polymerase sigma factor SigI  97.02 
 
 
235 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3137  putative RNA polymerase sigma factor SigI  96.65 
 
 
240 aa  443  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3441  putative RNA polymerase sigma factor SigI  97.45 
 
 
235 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.246792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0832  putative RNA polymerase sigma factor SigI  49.79 
 
 
245 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2309  putative RNA polymerase sigma factor SigI  39.44 
 
 
250 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2521  putative RNA polymerase sigma factor SigI  40.09 
 
 
235 aa  148  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000234194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0074  putative RNA polymerase sigma factor SigI  39.73 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2112  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.2 
 
 
253 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4761  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.74 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1739  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.62 
 
 
252 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3361  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.91 
 
 
294 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0602386  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0403  putative RNA polymerase sigma factor SigI  39.17 
 
 
274 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0521455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1698  putative RNA polymerase sigma factor SigI  40.67 
 
 
242 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.734467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2038  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.97 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1128  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.05 
 
 
255 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.552744  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1048  putative RNA polymerase sigma factor SigI  32.56 
 
 
227 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0315  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.81 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0058  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.06 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0944  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38 
 
 
259 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000529876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1272  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.89 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2120  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.43 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0268  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.77 
 
 
265 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1584  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.13 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  98.18 
 
 
872 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2975  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.1 
 
 
254 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0661  putative RNA polymerase sigma factor SigI  32.88 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00767119  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1805  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  38.64 
 
 
114 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2011  sigma 28 (flagella/sporulation)  23.53 
 
 
232 aa  55.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1664  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  30.68 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322849  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4416  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  26.67 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.197457  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3710  sigma 28 (flagella/sporulation)  31.51 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1343  flagellar biosynthesis sigma factor  32 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.600056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17700  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  30.38 
 
 
209 aa  42.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>