12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2916 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2916  putative hydrolase  100 
 
 
277 aa  577  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  62.5 
 
 
281 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  60.82 
 
 
277 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4040  hypothetical protein  61.19 
 
 
277 aa  341  7e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253336  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  60.22 
 
 
275 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3331  hypothetical protein  56.98 
 
 
282 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400491  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3562  hypothetical protein  58.53 
 
 
275 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3061  hypothetical protein  54.96 
 
 
275 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4780  hypothetical protein  59.68 
 
 
295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2390  hypothetical protein  56.86 
 
 
277 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325647  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  42.6 
 
 
526 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1120  hypothetical protein  36.5 
 
 
281 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.381858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>