46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2646 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2646  carboxysome peptide B  100 
 
 		 86 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0863  carboxysome peptide B  54.32 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.338106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3198  hypothetical protein  55.7 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.457559  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1384  carboxysome peptide B  54.43 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1686  carboxysome peptide B  54.43 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2647  carboxysome protein B  55.7 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0843  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  48.19 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.989668  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4337  microcompartments protein  50 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0917  carboxysome peptide B  51.9 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0554  putative carboxysome peptide A  49.4 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0555  putative carboxysome peptide B  46.34 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.672365  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06111  putative carboxysome peptide B  46.34 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.466585  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05811  putative carboxysome peptide B  46.34 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05801  putative carboxysome peptide A  49.4 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06181  putative carboxysome peptide A  51.9 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06191  putative carboxysome peptide B  47.5 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1385  carboxysome peptide A  45.12 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1687  carboxysome peptide A  45.12 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05571  putative carboxysome peptide B  47.56 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06101  putative carboxysome peptide A  48.19 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1982  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  45.12 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08141  putative carboxysome peptide B  49.37 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2648  carboxysome protein A  47.62 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1883  putative carboxysome peptide A  47.56 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06081  putative carboxysome peptide A  47.56 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.315065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1884  putative carboxysome peptide B  43.9 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0918  carboxysome peptide A  48.19 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06091  putative carboxysome peptide B  43.9 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2645  carboxysome peptide A  47.13 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0842  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  49.38 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.852836  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1983  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  48.19 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08131  putative carboxysome peptide A  48.1 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0862  carboxysome peptide A  46.99 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.298797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3199  carboxysome protein A  47.62 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05561  putative carboxysome peptide A  48.1 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0756  putative carboxysome peptide A  47.56 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.324398  normal  0.114801 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1610  putative carboxysome peptide A  47.56 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.306555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0757  putative carboxysome peptide B  42.68 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.316991  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0123  carboxysome peptide B  43.9 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1609  putative carboxysome peptide B  42.68 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179177  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4336  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  49.4 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2385  propanediol utilization protein  31.11 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2172  propanediol utilization domain protein  31.11 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2219  propanediol utilization protein  31.11 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2272  polyhedral body protein  31.11 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0235595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2226  propanediol utilization protein (pduK)  31.11 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>