37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1741 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1741  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 67 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1290  4-oxalocrotonate tautomerase  89.55 
 
 		 67 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0911  4-oxalocrotonate tautomerase  85.07 
 
 		 67 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1368  4-oxalocrotonate tautomerase  88.06 
 
 		 67 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1186  4-oxalocrotonate tautomerase  86.57 
 
 		 67 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.13377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  39.66 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.86 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.38 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.55 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  45.61 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  36.21 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.07 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.1 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  44 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  42.22 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5081  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 146 aa  40  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.218107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>