More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1556 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  100 
 
 		 439 aa  865    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  70.82 
 
 		 434 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  64.07 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  64.86 
 
 		 432 aa  547  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  68.86 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  65.26 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  62.74 
 
 		 436 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  62.74 
 
 		 436 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  62.74 
 
 		 436 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  61.54 
 
 		 438 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  61.89 
 
 		 433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  61.78 
 
 		 435 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  61.71 
 
 		 441 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1425  manganese/iron transporter  64.93 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  67.28 
 
 		 449 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  67.28 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  67.28 
 
 		 437 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1258  manganese/iron transporter  67.02 
 
 		 431 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1068  manganese/iron transporter  67.02 
 
 		 437 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.028316  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0230  manganese/iron transporter  67.02 
 
 		 437 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1050  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  62.47 
 
 		 441 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0502  manganese/iron transporter  67.02 
 
 		 437 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  56.02 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.28 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  54.45 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.63 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  49.53 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  50.12 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  50.12 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  49.75 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  51.78 
 
 		 411 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  50.51 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  49.26 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  49.26 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  50.13 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  46.97 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  50.13 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  50.52 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  50.52 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  50.52 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  50.52 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  46.73 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  49.36 
 
 		 412 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  46.15 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.81 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  46.15 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  45.91 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  48.04 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  45.15 
 
 		 432 aa  362  8e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  46.97 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  49.36 
 
 		 423 aa  359  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  46.73 
 
 		 431 aa  358  7e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  46.73 
 
 		 431 aa  358  7e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  47.74 
 
 		 431 aa  359  7e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  41.92 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  46.49 
 
 		 431 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  46.49 
 
 		 431 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.87 
 
 		 409 aa  331  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.85 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  44.44 
 
 		 425 aa  313  5.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  40.71 
 
 		 453 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  41.38 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0654  manganese transport protein MntH  45.59 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0327142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  42.89 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  42.93 
 
 		 463 aa  299  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.41 
 
 		 444 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  41.18 
 
 		 456 aa  296  7e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  44.03 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  41.72 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.38 
 
 		 444 aa  294  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  41.78 
 
 		 450 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  40.29 
 
 		 463 aa  292  9e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  41.56 
 
 		 448 aa  292  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  40.09 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  42.86 
 
 		 401 aa  290  5.0000000000000004e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0099  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.72 
 
 		 431 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.510784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.86 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  40.5 
 
 		 462 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  43.24 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  44.59 
 
 		 442 aa  286  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  42.13 
 
 		 454 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  46.51 
 
 		 441 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.27 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  41.99 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  40.52 
 
 		 622 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  42.01 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  42.54 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  45.69 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.22 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  41.12 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  43.52 
 
 		 418 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  39.96 
 
 		 460 aa  282  9e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>