265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0622 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0622  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
402 aa  818    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  46.37 
 
 
400 aa  362  9e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  45.61 
 
 
400 aa  361  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0258  aromatic amino acid aminotransferase  46.89 
 
 
397 aa  355  5.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805821  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  44.44 
 
 
398 aa  345  7e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4445  aromatic amino acid aminotransferase  44.95 
 
 
397 aa  345  8e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.451024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  43.18 
 
 
398 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4592  aromatic amino acid aminotransferase  46.37 
 
 
397 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  47.03 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4591  aromatic amino acid aminotransferase  46.11 
 
 
397 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  44.07 
 
 
398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4898  aromatic amino acid aminotransferase  42.86 
 
 
399 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  44.07 
 
 
398 aa  338  9e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  47.03 
 
 
398 aa  338  9e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4497  aromatic amino acid aminotransferase  46.11 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  45.99 
 
 
398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4505  aromatic amino acid aminotransferase  45.85 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  44.95 
 
 
400 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  43.15 
 
 
398 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  44.33 
 
 
401 aa  335  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  42.96 
 
 
401 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  44.59 
 
 
401 aa  335  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4643  aromatic amino acid aminotransferase  45.85 
 
 
397 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.319396  normal  0.236394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  44.58 
 
 
399 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
402 aa  332  7.000000000000001e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  47.03 
 
 
398 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  45.08 
 
 
397 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  43.29 
 
 
399 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  45.08 
 
 
397 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0702  aromatic amino acid aminotransferase  43.69 
 
 
397 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  45.08 
 
 
397 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03886  hypothetical protein  45.08 
 
 
397 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0274153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  44.81 
 
 
398 aa  330  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  42.75 
 
 
399 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  41.6 
 
 
398 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  42.75 
 
 
396 aa  329  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1762  aromatic amino acid aminotransferase  44.7 
 
 
400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0798  aromatic amino acid aminotransferase  44.7 
 
 
400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0667  aromatic amino acid aminotransferase  44.7 
 
 
400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.588804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2395  aromatic amino acid aminotransferase  44.7 
 
 
400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.441327  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1187  aromatic amino acid aminotransferase  44.7 
 
 
400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  44.7 
 
 
400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3939  Aromatic-amino-acid transaminase  45.08 
 
 
397 aa  329  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4515  aromatic amino acid aminotransferase  44.82 
 
 
397 aa  329  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  43.04 
 
 
402 aa  328  7e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  45.22 
 
 
398 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  44.7 
 
 
398 aa  328  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4541  aromatic amino acid aminotransferase  44.82 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  44.96 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  45.22 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  44.96 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4017  aromatic amino acid aminotransferase  44.19 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5556  aromatic amino acid aminotransferase  45.08 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4350  aromatic amino acid aminotransferase  44.19 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461114  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  44.82 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0753  aromatic amino acid aminotransferase  42.93 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137496  normal  0.117854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6004  aromatic amino acid aminotransferase  44.19 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.443783  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  43.97 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  46.51 
 
 
398 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  44.7 
 
 
398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  42.01 
 
 
398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 
398 aa  325  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  46.68 
 
 
399 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3642  aromatic amino acid aminotransferase  43.51 
 
 
397 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.463621  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  45.22 
 
 
398 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  43.32 
 
 
399 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  43.22 
 
 
398 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  43.22 
 
 
398 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  43.22 
 
 
398 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  42.27 
 
 
398 aa  323  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  44.19 
 
 
400 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1670  aromatic amino acid aminotransferase  43.94 
 
 
400 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3759  aromatic amino acid aminotransferase  43.94 
 
 
400 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4233  aromatic amino acid aminotransferase  44.19 
 
 
400 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0924  aromatic amino acid aminotransferase  43.81 
 
 
398 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2076  aromatic amino acid aminotransferase  44.44 
 
 
430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  43.41 
 
 
399 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3853  aromatic amino acid aminotransferase  42.93 
 
 
397 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  43.04 
 
 
398 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3763  aromatic amino acid aminotransferase  42.93 
 
 
397 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  37.76 
 
 
398 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  45.24 
 
 
398 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  42.71 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  42.71 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  46.68 
 
 
399 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  42.93 
 
 
402 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  43.15 
 
 
399 aa  318  7e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0879  aromatic amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
399 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1919  aromatic amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
399 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0916  aromatic amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
399 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2037  aromatic amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
399 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2128  aromatic amino acid aminotransferase  46.95 
 
 
399 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0016  aromatic amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
399 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6526  aromatic amino acid aminotransferase  42.28 
 
 
396 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.506561  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2249  aromatic amino acid aminotransferase  46.95 
 
 
399 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0506  aromatic amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
399 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0603  aromatic amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
399 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48132  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1738  aromatic amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
399 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2280  aromatic amino acid aminotransferase  43.04 
 
 
405 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>