36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0107 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0107  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.629422 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1935  excinuclease ABC subunit C  53.75 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.517176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2985  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.25 
 
 		 80 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00056528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0402  excinuclease ABC subunit C  58.23 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4364  putative excinuclease ABC protein, C subunit  57.35 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0179482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0062  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.43 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.330089  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  53.95 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1944  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.51 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.27 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0597  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.27 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1593  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.758459 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  37.66 
 
 		 81 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.94 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.37 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.31 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  34.57 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  32.53 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  32.53 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  35.82 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.71 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  41.79 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  33.82 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.3 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.3 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.52 
 
 		 88 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  40 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  41.82 
 
 		 338 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  34.57 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.75 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.8 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3457  GIY-YIG nuclease superfamily protein  33.75 
 
 		 120 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3459  GIY-YIG nuclease superfamily protein  33.75 
 
 		 120 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3565  GIY-YIG nuclease superfamily protein  33.75 
 
 		 120 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3528  GIY-YIG nuclease superfamily protein  33.75 
 
 		 120 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35 
 
 		 80 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>