49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  292  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  61.22 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2893  hypothetical protein  56.55 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34020  hypothetical protein  56.55 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  0.0827701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1730  hypothetical protein  31.54 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0454443  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  31.4 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.17 
 
 		 151 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.45 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.51 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  33.98 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  33.93 
 
 		 178 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  33.93 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  33.93 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  33.93 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  33.93 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  33.93 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  33.93 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  33.04 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  32.35 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  34.02 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  34.83 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  32.14 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  28.1 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.84 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.67 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.97 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  30.34 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.91 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  29.91 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  29.91 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  29.91 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  25 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  29.75 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  32.14 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.72 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  25 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  34.67 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  29.33 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>