200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5280 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  55.85 
 
 		 272 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  53.03 
 
 		 270 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  53.21 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  55.09 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  45.8 
 
 		 268 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  43.08 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  42.59 
 
 		 273 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  44.19 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  43.48 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  41.57 
 
 		 272 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  42.75 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  43.75 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  42.96 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  44.88 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  41.22 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  40.77 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0261  creatininase  41.38 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  41.57 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  41.7 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  40.15 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  44.32 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  41.41 
 
 		 270 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  42.52 
 
 		 289 aa  201  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  41.15 
 
 		 261 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  38.11 
 
 		 265 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  45.64 
 
 		 282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  41.6 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  38.93 
 
 		 272 aa  195  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  39.78 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  40.16 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0569  creatininase  39.52 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  39.46 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  39.83 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  37.98 
 
 		 275 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  43.08 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  43.07 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  41.06 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  41.46 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  38.76 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  39 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  41.63 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  40.17 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  42.26 
 
 		 275 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  41.92 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  39.59 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  39.59 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  36.02 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  35.77 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  35.77 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  36.51 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2766  creatininase  37.11 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  40.25 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  39.6 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  36.51 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  34.31 
 
 		 247 aa  149  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  34.96 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  35.08 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  36.21 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  32.77 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  31.2 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  30.8 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  33.94 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  32.57 
 
 		 264 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  31.19 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  33.87 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  33.64 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  29.82 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  33.2 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  31.4 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  29.49 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  34.51 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3103  Creatininase  30.9 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  34.17 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0910  Creatininase  29.31 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0580  Creatininase  27.5 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0945  Creatininase  30.51 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.372006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1961  creatininase  30.87 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1389  Creatininase  27.82 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0548  Creatininase  30.9 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.105845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  28.63 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3192  Creatininase  27.56 
 
 		 244 aa  96.3  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0080  Creatininase  28.81 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3275  creatininase  28.78 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3150  creatininase  33.19 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3204  creatininase  32.34 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3774  Creatininase  31.3 
 
 		 237 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0114  creatininase  28 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.863152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  28.57 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2975  Creatininase  30.77 
 
 		 243 aa  89  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448645  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0769  Creatininase  32.66 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0661  creatininase  26.95 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00264542  normal  0.775267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  29.6 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2403  Creatininase  25.83 
 
 		 245 aa  85.5  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4930  Creatininase  31.51 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0306172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0439  Creatininase  27.05 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2750  Creatininase  29.63 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000405281  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0205  Creatininase  29.29 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5108  Creatininase  33.52 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1638  creatininase  29.49 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>