33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2985 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2985  tail assembly protein  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3720  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  29.85 
 
 		 205 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  28.12 
 
 		 240 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  26.85 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16250  NLP/P60 protein  29.27 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  21.01 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  28.23 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  24.58 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  26.55 
 
 		 189 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  26.98 
 
 		 209 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  26.09 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  24.58 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0020  NLP/P60 protein  29.66 
 
 		 184 aa  41.2  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  23.44 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  23.44 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  23.44 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  23.44 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  23.44 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  23.44 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  23.44 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  23.44 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  23.44 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  30.71 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  24.22 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  23.73 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0303  NLP/P60 protein  28.83 
 
 		 357 aa  40.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  25 
 
 		 166 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>