61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2595 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 		 494 aa  1012    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  47.76 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  59.83 
 
 		 245 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  58.05 
 
 		 241 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  54.43 
 
 		 245 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  43.93 
 
 		 240 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  40.34 
 
 		 241 aa  186  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  45.56 
 
 		 253 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  37.82 
 
 		 246 aa  172  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  41.53 
 
 		 253 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  24.28 
 
 		 529 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  24.47 
 
 		 548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  32.77 
 
 		 240 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  31.82 
 
 		 251 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  35.27 
 
 		 267 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  30.92 
 
 		 254 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  33.2 
 
 		 246 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  30.47 
 
 		 258 aa  103  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.51 
 
 		 243 aa  99.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 243 aa  94.7  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  27.53 
 
 		 242 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  27.76 
 
 		 242 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  30.45 
 
 		 240 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  26.69 
 
 		 247 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.22 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  29.09 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  26.82 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1604  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.56 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  25.89 
 
 		 231 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  27.03 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  25 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  23.69 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  24.38 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  25.52 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  27.51 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  26.82 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  22.32 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  27.43 
 
 		 232 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  23.56 
 
 		 330 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  24.07 
 
 		 338 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.08 
 
 		 349 aa  55.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  21.33 
 
 		 325 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.67 
 
 		 331 aa  51.2  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  20.28 
 
 		 328 aa  50.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  23.79 
 
 		 243 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  21.86 
 
 		 336 aa  48.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  28.16 
 
 		 222 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  24.58 
 
 		 237 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 592 aa  46.6  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0137  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.26 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00181473  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  20.27 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  26.04 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0877  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  22.43 
 
 		 254 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  28.68 
 
 		 326 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  40.35 
 
 		 596 aa  43.9  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  22.16 
 
 		 348 aa  43.9  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  41.3 
 
 		 590 aa  43.9  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2889  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  21.03 
 
 		 259 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  23.31 
 
 		 237 aa  43.5  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>