246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0722 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0722  flagellar motor switch protein G  100 
 
 		 347 aa  695    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0342  flagellar motor switch protein G  81.5 
 
 		 346 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320445  normal  0.0115185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0310  flagellar motor switch protein G  80.92 
 
 		 346 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0247  flagellar motor switch protein G  67.45 
 
 		 345 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0377031  normal  0.550759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0306  flagellar motor switch protein G  42.37 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4221  flagellar motor switch protein G  34.81 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967064  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1152  flagellar motor switch protein G  33.54 
 
 		 362 aa  192  9e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0113  flagellar motor switch protein G  34.26 
 
 		 351 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.150638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1715  flagellar motor switch protein FliG  31.74 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635605  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2807  flagellar motor switch protein FliG  31.85 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.996528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3216  flagellar motor switch protein FliG  33.73 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.476285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1092  flagellar motor switch protein FliG  32.08 
 
 		 344 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0649  flagellar motor switch protein FliG  34.33 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0638  flagellar motor switch protein FliG  34.33 
 
 		 359 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  0.23501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0021  flagellar motor switch protein FliG  31.38 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0617  flagellar motor switch protein FliG  34.55 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1651  flagellar motor switch protein FliG  28.75 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1875  flagellar motor switch protein G  28.19 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1458  flagellar motor switch protein G  28.57 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3845  flagellar motor switch protein G  27.7 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00997148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0942  flagellar motor switch protein G  27.99 
 
 		 362 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1273  flagellar motor switch protein G  27.7 
 
 		 362 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0206621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  29.75 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0570  flagellar motor switch protein FliG  28.36 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0690  flagellar motor switch protein G  27.22 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  28.62 
 
 		 333 aa  126  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1474  flagellar motor switch protein G  26.54 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0598  flagellar motor switch protein G  26.53 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  24.7 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  26.92 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  28.17 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  25.36 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  26.96 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  28.57 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  28.57 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3459  flagellar motor switch protein G  28.19 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  normal  0.0569561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  28.53 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  30.18 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0544  flagellar motor switch protein G  27 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2560  flagellar motor switch protein FliG  30.36 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00224788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2464  flagellar motor switch protein FliG  30.36 
 
 		 349 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00903662  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  27.78 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  25.93 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  25.93 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4572  flagellar motor switch protein G  26.58 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  27.74 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0648  flagellar motor switch protein FliG  27.96 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0245668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  26.41 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4459  flagellar motor switch protein G  26.58 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  27.53 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4091  flagellar motor switch protein G  26.58 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0769367  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  27.16 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  27.41 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  28.44 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1393  flagellar motor switch protein FliG  30.03 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  26.73 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  25.69 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  29 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0138  flagellar motor switch protein FliG  30.42 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.902934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  27.62 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1764  flagellar motor switch protein FliG  27.53 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5058  flagellar motor switch protein G  26.45 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0468557  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  26.94 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  26.81 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5125  flagellar motor switch protein G  26.71 
 
 		 350 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  26.1 
 
 		 331 aa  113  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  26.96 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  25.83 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  25.3 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  27.8 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  25.83 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  24.85 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  28.1 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6058  flagellar motor switch protein G  26.03 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  26.71 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  26.53 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5098  flagellar motor switch protein G  26.09 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1191  flagellar motor switch protein FliG  28.87 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  28.18 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1013  flagellar motor switch protein G  26.89 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.19786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  28.18 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  26.27 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  27.08 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  26.3 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  27.22 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  26.97 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  26.97 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  26.3 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  23.19 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  27.98 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0039  flagellar motor switch protein FliG  27.99 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.81346  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  23.68 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  26.3 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  25.3 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  24.85 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0977  flagellar motor switch protein FliG  26.79 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2291  flagellar motor switch protein G  27.66 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.60642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2013  flagellar motor switch protein G  27.66 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1346  flagellar motor switch protein FliG  26.4 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2392  flagellar motor switch protein G  27.66 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>