43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0335 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  77.33 
 
 		 424 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  77.83 
 
 		 424 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  872    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  70.42 
 
 		 426 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  64.32 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  62.78 
 
 		 431 aa  511  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  57.28 
 
 		 420 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  58.35 
 
 		 441 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  58.98 
 
 		 422 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  58.22 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  61.19 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  60.45 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  54.98 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  56.96 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  57.22 
 
 		 445 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  57.47 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  56.96 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  56.96 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  53.33 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  53.12 
 
 		 445 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  53.69 
 
 		 420 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  53.83 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  51.91 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  53.06 
 
 		 475 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  49.53 
 
 		 431 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  53.09 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  54.33 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  53.68 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  51.85 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  40.45 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  45.71 
 
 		 486 aa  263  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  38.08 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  38.07 
 
 		 482 aa  256  6e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  40.1 
 
 		 480 aa  251  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  39.46 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  38.85 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  40.73 
 
 		 407 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  38.14 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  35.87 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  26.69 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  21.66 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  21.74 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  20.83 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>